fix(notebooks,#20167): lot A2 -- retire execution_count/outputs des cellules markdown de 5 carnets jumelés

[jsboige]

See #20167
Hors flotte (exemption #17713).

Mise à jour du 2026-10-16 (23:50Z) : fusion de #20827 traitée

#20827 a été fusionnée la première ; le recouvrement annoncé plus bas est donc réglé ici. Trois commits, nouvelle tête 438e0e24fa.

1. Fusion de main (454ec77b47). Le seul conflit portait sur la liste known_differences de app-13-tsp-metaheuristics.yaml. Les deux entrées sont conservées : celle de cette PR, redatée au 2026-10-16, puis celle de Docs(app13,#18144): realigne la prose TSP sur les instances executees #20827.
2. Retrait de mon attestation 0019-2026-10-14-hors-flotte-claude-session-20167.yaml (0c1dda4303). Sur main, l'index 0019 est déjà pris par l'attestation de Docs(app13,#18144): realigne la prose TSP sur les instances executees #20827, et test_audit_index_unique interdit les doublons. De plus, son python_sha datait d'avant la ré-exécution de Docs(app13,#18144): realigne la prose TSP sur les instances executees #20827.
3. Nouvelle attestation de la paire par --update, entrée 0021-2026-10-16-hors-flotte-claude-session-20167.yaml (438e0e24fa). Elle enregistre python_sha 6924e35c (le carnet Python tel que Docs(app13,#18144): realigne la prose TSP sur les instances executees #20827 l'a laissé, identique à son entrée 0020) et csharp_sha 37ebd6dc (le carnet C# de cette PR).

Vérifications sur la nouvelle tête :

• check_twin_parity.py --check --json : 151 OK, 6 DRIFT. Ces 6 paires (App-1, App-2, CSP-3, CSP-7, Search-09, SL-8) sont en dérive à l'identique sur origin/main (c371a2c03a, même commande) ; aucune n'est touchée par cette PR, et App-13 est OK.
• scripts/notebook_tools/tests/test_twin_registry_integrity.py : 46 passed.
• Les 5 carnets : 0 cellule markdown portant execution_count ou outputs, et 98/98 cellules de code avec execution_count non nul.
• Périmètre inchangé : 15 fichiers, +35/−135.

Summary

• Partie du lot A de fix(notebooks): 37 carnets portent une cellule markdown avec execution_count/outputs -- schema nbformat invalide, le MCP jupyter-papermill refuse d'ecrire le fichier #20167, détachée de la PR fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588. Avant la scission, celle-ci dépassait le seuil de pr-review-discipline §A (28 chemins pour un maximum de 15) (constat du préflight de l'adjoint sur fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588).
• Cinq carnets ont un jumeau enregistré : App-13b, App-17b, CSP-6, SW-11 et Tweety-07a. La PR retire execution_count et outputs de 68 cellules markdown (135 clés). Aucune source, aucune cellule de code, aucune sortie de code ni aucune métadonnée de carnet ne change, donc aucune ré-exécution n'est due (C.2).
• Les cinq paires jumelles sont ré-attestées. Une ligne known_differences est ajoutée au YAML parent, plus une entrée d'audit par paire. Ces 15 fichiers reprennent à l'identique la tête c46316f857 de fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588. Aucun d'eux n'a changé sur main depuis la base de fusion de fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588 (6c3b4e9833), donc les SHA attestés restent ceux des blobs livrés ici.
• La PR ne dépend pas du merge de fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588. Le correcteur fix_markdown_cell_schema.py y a produit ces modifications, mais leur vérification n'a pas besoin de lui : c'est une comparaison structurelle (voir Validation).

Changes

Fichier	Changement
Search/Applications/Hybrid/App-13b-TSP-Metaheuristics-CSharp.ipynb	2 cellules markdown nettoyées
Search/Applications/Hybrid/App-17b-VRP-Logistics-CSharp.ipynb	2 cellules markdown nettoyées
Search/Part2-CSP/CSP-6-Hybridization.ipynb	1 cellule markdown nettoyée
SymbolicAI/SemanticWeb/SW-11-Python-KnowledgeGraphs.ipynb	60 cellules markdown nettoyées
SymbolicAI/Tweety/Tweety-07a-Extended-Frameworks-CSharp.ipynb	3 cellules markdown nettoyées
twin_pairs.d/{app-13-tsp-metaheuristics,app-17-vrp-logistics,csp-6-hybridization,sw-11-knowledge-graphs,tweety-7a-extended-frameworks}.yaml	une ligne en tête de known_differences
twin_pairs.d/<paire>/00xx-2026-10-14-hors-flotte-claude-session-20167.yaml (5)	entrée d'audit : blobs de tête attestés

Validation

Tous les contrôles ont été lancés sur le commit 6b577a2232 (tête de cette PR), base origin/main 2ee98646c1.

Équivalence structurelle, par un script local. Pour chaque carnet, on part du JSON de la base, on retire execution_count et outputs des seules cellules markdown, puis on compare au JSON de tête :

OK  App-13b-TSP-Metaheuristics-CSharp.ipynb cles retirees: 4
OK  App-17b-VRP-Logistics-CSharp.ipynb cles retirees: 4
OK  CSP-6-Hybridization.ipynb cles retirees: 1
OK  SW-11-Python-KnowledgeGraphs.ipynb cles retirees: 120
OK  Tweety-07a-Extended-Frameworks-CSharp.ipynb cles retirees: 6
total 135

Égalité stricte pour les cinq carnets : rien d'autre n'a changé.

Autres contrôles :

fix_markdown_cell_schema.py --check <5 carnets>   (outil pris à la tête de #20588)
  -> Bilan --check : 0 carnet(s) fautif(s), 0 illisible(s), sur 5 examine(s).
nbformat.validate                                  -> 5/5 OK
check_twin_parity.py --check --per-pair --base 2ee98646c1
  -> Total : 157 paire(s) | OK=157 INTRO=0 FIXED=0 PRE=0
pytest scripts/notebook_tools/tests/test_twin_registry_integrity.py
  -> 46 passed

Voie rapide locale (scripts/ci/fast_lane.py --dry-run --base-ref origin/main) : un seul garde bloquant est rouge, check-nav-chain. Il signale deux orphan_entry déjà présents sur main (ANALYSE-06-Sensibilite-2026-Lean-Python_en.ipynb, ANALYSE-10-Reflexion-Thurston-Python.ipynb), dans des carnets étrangers à cette PR, et le correctif est #20704. perimeter-review-guard et hr-substitution-guard sont en mode ombre, non bloquant, et ont besoin du body de la PR.

Recouvrement connu

#20827 ré-atteste aussi la paire app-13-tsp-metaheuristics : même YAML parent, avec une entrée 0019-…-session-18144 contre 0019-…-session-20167 ici. La seconde PR mergée devra fusionner main, puis ré-attester la paire avec les deux côtés.

Review Checklist

1. Scope réel : OK. 15 fichiers, au seuil sans le dépasser. Cinq carnets nettoyés et les cinq ré-attestations qui en découlent, rien d'autre.
2. Validation post-fix : OK. Équivalence structurelle, parité des jumeaux et tests du registre relancés sur la tête.
3. Cohérence pédagogique : sans objet. Aucune source de cellule ne change.
4. Exécution réelle : sans objet (C.2). Aucune cellule de code ni sortie de code n'est modifiée ; les sorties committées restent celles de la base.
5. Regression check : OK. La comparaison structurelle montre qu'aucune autre clé ne bouge, et check_twin_parity reste à 157/157.

Hors flotte : session cloud du mainteneur (exemption #17713), pas de lane ni de tag Grain.

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Generated by Claude Code

[clusterManager-Myia]

[Hermes] — Lot A2 #20167 : retrait schema-markdown + re-attestation des 5 paires jumelles — vérifié firsthand, LGTM

Équivalence structurelle reproduite sur le head 6b577a22 (base 2ee98646c1) : pour chacun des 5 carnets, le JSON de base auquel on retire execution_count/outputs des seules cellules markdown est égal strictement au JSON de tête. Clés retirées : App-13b=4, App-17b=4, CSP-6=1, SW-11=120, Tweety-07a=6 — total 135, conforme au body. Toutes les cellules code byte-identiques base↔head (vérifié cellule à cellule).

Blob SHAs recalculés (sha1 blob git, méthode memory) conformes aux 5 entrées d'audit 0019/0008/0014/0014/0020-2026-10-14-hors-flotte-claude-session-20167.yaml :

• App-13b csharp_sha 37ebd6dc… ✓ · App-17b csharp_sha 11a8f1b9… ✓ · CSP-6 python_sha c2535ffa… ✓ · SW-11 python_sha 28a47165… ✓ · Tweety-07a csharp_sha 4eead0d9… ✓

Lignes known_differences des 5 YAML parents : même formulation d'attestation (attestation, pas réparation — le blob SHA se déplace), cohérente avec l'opération schema-only. Rien d'autre ne change dans les registres.

Scan sécurité : négatif. Regle C.2 : aucune ré-exécution due — aucune source, sortie ni métadonnée de cellule code ne bouge. Recouvrement #20827 (paire app-13) documenté dans le body : la seconde PR mergée devra ré-attester, correctement anticipé.

Advisory mineur : le body cite check_twin_parity 157/157 — à dater du 14/10. La paire ap-13 est attestée en double (entrées 0019 des sessions 18144 et 20167, PR #20827) ; l'outil trie par date, pas d'ambiguïté bloquante.

Une réserve de forme sur le registre — pas bloquante : dans l'entrée tweety-7a…, la clé python_sha: 2b2c7044… ne correspond pas au blob du jumeau Python à la base 2ee98646c1 (verify.py : mismatch flaggé) — trace de l'historique des attestations, pas de cette PR ; l'entrée 0020 atteste le côté édité (csharp). Si l'écart persiste après merge, une ré-attestation Python du registre apurerait.

[clusterManager-Myia]

Erratum [Hermes] sur ma review précédente : la dernière réserve (« python_sha 2b2c7044… de l'entrée tweety-7a 0020 ne correspond pas au blob du jumeau Python à la base ») est retirée — elle était fausse. Vérifié à l'instant : le blob Tweety-07a-Extended-Frameworks-Python.ipynb à la base 2ee98646c1 est exactement 2b2c7044… — l'entrée 0020 est conforme, rien à apurer. Le reste de la review tient (équivalence structurelle 135 clés, blob SHAs des 5 entrées d'audit recalculés conformes, LGTM sans réserve résiduelle).

[jsboige]

Advisory sur le décompte check_twin_parity : la mesure 157/157 est épinglée dans le body par sa base (--base 2ee98646c1), sur la tête 6b577a22, le 15/10 vers 10:20Z. Elle reste telle quelle. Erratum sur l'entrée tweety-7a 0020 bien noté, rien à apurer de ce côté.

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Generated by Claude Code

[jsboige]

PR gate n'est pas vert sur la tête 6b577a2232, mais aucun check n'y a échoué sur le contenu.

Ses jobs enfants (validate, Gitleaks secret scanner, Source-output ratchet, etc.) ont attendu en file de 10:24Z à 11:23Z, puis ont été annulés sans runner attribué et sans aucune étape exécutée (runner_name vide, liste d'étapes vide). C'est la saturation de la file de runners. PR gate ne fait que constater ces annulations.

Je ne relance pas maintenant : une relance repartirait dans la même file. Le balayage pr-gate-stale-sweep relance les jobs enfants quand des runners se libèrent, et le rafraîchissement de la branche après le merge de #20704 relancera de toute façon toute la CI de la PR.

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Generated by Claude Code

[jsboige]

Le check Scripts Tests (CPU) est rouge sur la tête 6b577a2232, mais le job n'a exécuté aucun test.

• Ce qui a échoué : la collecte pytest-xdist s'est arrêtée avant le premier test (KeyError: <WorkerController>), classée XDIST-WATCHDOG: COLLECT_CRASH (signature ci: Scripts Tests (CPU) -- un worker xdist mort en collecte leve KeyError WorkerController et rougit des PRs saines #19915) par le garde du workflow, qui la décrit comme un défaut transitoire à rejouer.
• Lien avec la PR : aucun (elle modifie MyIA.AI.Notebooks/Search/Applications, MyIA.AI.Notebooks/Search/Part2-CSP, MyIA.AI.Notebooks/SymbolicAI/SemanticWeb, MyIA.AI.Notebooks/SymbolicAI/Tweety, scripts/notebook_tools/twin_pairs.d).
• Pourquoi je ne relance pas maintenant : une relance qui passerait la collecte tomberait sur test_full_repo_state_passes_parity (paire 01-2-GPT-5-Image-Generation / _en), rouge sur main depuis Tp2 #20551 et corrigé par fix(i18n,#20551): parite EN 01-2-GPT-5-Image -- rendu T4 des cellules TP2 (main rouge Scripts Tests) #20589 ou fix(translation,#20551): re-rendu EN de 01-2 GPT-5 Image -- repare la parite FR/EN rouge sur main #20777, pas encore mergées. Avec la file CI actuelle, ce serait occuper un runner pour un rouge certain.
• Suite : dès que fix(i18n,#20551): parite EN 01-2-GPT-5-Image -- rendu T4 des cellules TP2 (main rouge Scripts Tests) #20589 ou fix(translation,#20551): re-rendu EN de 01-2 GPT-5 Image -- repare la parite FR/EN rouge sur main #20777 sera mergée, je rafraîchirai la branche sur main, ce qui relancera la jambe complète sur un commit de fusion sain.

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Generated by Claude Code

[github-actions]

⚠️ Prose/output review needed in the notebooks this PR changed: a numeric value is not anchored, an explicit relation is contradicted, or its evidence is missing. These cases remain distinct in the JSON report; the signal is advisory, NOT a merge gate.

Scope = notebooks CHANGED in this PR, not the whole corpus. Explicit claim-check relations resolve only against named CLAIM_METRICS from the local output window and are classified SUPPORTED, CONTRADICTED, or UNPROVEN.
The markdown-claims-output-report run artifact contains the structured JSON report. See python scripts/check_markdown_claims_output.py --help for re-running locally.
Detector rationale: c.290 / c.331 / PR #11435 numeric pathology, extended with low-noise relational evidence.

[github-actions]

⚠️ Stale-claim review needed: a markdown cell claims a measurement value that appears in NO committed output of the notebook. Advisory, NOT a merge gate — triage against the JSON artifact.

Scope = notebooks CHANGED in this PR, not the whole corpus. The stale-claim-report run artifact holds the structured JSON.
Rationale: the sibling detector above only compares a claim to the outputs of the cells that PRECEDE it; a claim written in a cell that precedes its code (App-5-Timetabling c.2/c.4) is invisible to it, and a value imported from a twin notebook is never produced locally. See python scripts/check_stale_claims.py --help.

[github-actions]

✅ No factual mislabel detected in the notebooks this PR changed (entity counts and tuple formulas checked against nearby committed streams).

Scope = notebooks CHANGED in this PR, not the whole corpus. The factual-mislabel-report run artifact holds the structured JSON.
Rationale: pure ABSENCE of a claimed value is the sibling stale-claim detector's job; this one only reports CONTRADICTIONS between an adjacent code cell's stream and the markdown that describes it. See python scripts/check_factual_mislabel.py --help.

[github-actions]

Path-collision (organ #13359/#13615)

Cette PR #20924 (fix(notebooks,#20167): lot A2 -- retire execution_count/outputs des cellules markdown de 5 carnets jumelés) touche au moins un chemin de fichier aussi modifie par d'autres PRs ouvertes. Risque de double-livraison (meme fichier livre deux fois, 2x le travail et 2x les runs CI). Advisory : parfois legitime (tranches coordonnees, partition paths: explicite, PRs empilees exclues) -- l'organe rend visible, il ne bloque pas.

• faible -- fix(csp,#18144): CSP-6 -- timings des tables de lecture resynchronises sur re-exec fraiche #20959 partage : MyIA.AI.Notebooks/Search/Part2-CSP/CSP-6-Hybridization.ipynb

[github-actions]

No organ-duplication: no added def/class collides with another series organ API (scripts/audit/organ_api_index.yaml).

Detector: python scripts/audit/detect_organ_duplication.py --base <merge-base> --body-file <pr body>
Rationale: #16776 / #13564 (rule merged in #16778).

[github-actions]

Golden-Set Execution (H.7 P3)

✅ 9/9 notebooks passed (certified reproducible)

Notebook	Status	Time
2.1-Workflow-ML.ipynb	✅ SUCCESS	10.8s
2.2-Descente-de-gradient.ipynb	✅ SUCCESS	7.2s
2.3-Regression-lineaire-logistique.ipynb	✅ SUCCESS	10.2s
2.4-Arbres-Forets-Ensembles.ipynb	✅ SUCCESS	8.7s
Search-01-StateSpace.ipynb	✅ SUCCESS	10.3s
SL-1-LogicalLearning.ipynb	✅ SUCCESS	5.3s
RL-04-Bandits-Manchots-Python.ipynb	✅ SUCCESS	51.2s
GameTheory-04c-NashExistence-Python.ipynb	✅ SUCCESS	8.5s
GameTheory-13d-Optimistic-CFR-Python.ipynb	✅ SUCCESS	29.3s

Pinned lockfile: scripts/notebook_tools/golden_set.lock.txt (H.7 P3, axe A #4208)

[github-actions]

Notebook PR Validation: PASS

• Notebooks checked: 5
• Code cells validated: 97
• Result: All passed

Checks: H.1 (no errors), H.3 (execution_count), C.1 (no banned patterns)
Non-Python kernels (.NET/Lean): C.1 + errors only (execution_count advisory)
QuantConnect notebooks: C.1 + errors only (require QC Cloud for execution)

[github-actions]

Notebook outputs-required (H.4 schema): PASS (every code cell carries an outputs: list)

[jsboige]

[ADJOINT PREFLIGHT]
schema: 1
lane: myia-po-2024:CoursIA
pr: 20924
head: 966011f
complete: true
body: read
comments-reviewed: 12
reviews-reviewed: 1
threads-reviewed: 0
threads-unresolved: 0
surfaces-sha256: 2fe5cc51dbae4acb6247e2b33647f1f5beeb27ac53d79862a0d46f5e405d06c9
diff-files: 15
diff-additions: 35
diff-deletions: 135
checks: latest-wins-green
b0: clear
scope: pass
domain: pass
verdict: READY
organ: check_adjoint_prevalidation.py
organ-command: python scripts/check_adjoint_prevalidation.py --derive-verdict 20924
organ-rc: 0
[/ADJOINT PREFLIGHT]

Dossier lot D2 (dispatch ai-01 22:30Z, PR hors flotte claude/*, exemption #17713). Evidence :

• Surfaces : body integral lu (Summary, Changes, Validation equivalence structurelle, Recouvrement connu, Review Checklist) ; 12 commentaires lus (8 advisories github-actions, 1 erratum Hermes retirant sa derniere reserve — verifie fausse, 3 commentaires jsboige documentant advisory decompte twin epingle par sa base, PR gate non-vert sans echec de contenu, collecte pytest arretee) ; 1 review lue (Hermes COMMENTED LGTM 11:40:04Z : equivalence structurelle REPRODUITE firsthand au head 6b577a2, cles retirees par carnet citees) ; threads derives : 0 non-resolus.
• B.0 : check_unaddressed_nits.py 20924 rc=0 — la reserve Hermes (python_sha tweety-7a 0020) a ete RETIREE par erratum de l'auteur de la reserve lui-meme 11:41:10Z (« elle etait fausse », blob reverifie) : levee par l'auteur de la reserve, forme valide.
• Ecart review/tete : Hermes et l'equivalence structurelle portent sur le head anterieur 6b577a2 ; la tete courante 966011f est un rafraichissement base (sans conflit) — checks re-agreges verts a cette tete, le delta n'est pas du contenu d'auteur.
• Checks : latest-wins-green a la tete exacte — 90 noms / 90 OK (rouges anterieurs PR gate/Scripts Tests documentes par les commentaires comme infra/base-inherited, supersedes).
• Verification schema FIRSTHAND (consigne du dispatch, famille fix(notebooks): 37 carnets portent une cellule markdown avec execution_count/outputs -- schema nbformat invalide, le MCP jupyter-papermill refuse d'ecrire le fichier #20167 — execution_count/outputs retires des cellules markdown) : les 5 carnets a la tete 966011f telecharges via API — 0 cellule markdown ne porte execution_count ou outputs ; les 98/98 cellules code (11+14+17+38+18) gardent execution_count non null ET outputs. Exactement le geste demande, sans toucher au code.
• Scope : +35/-135 sur 15 fichiers = 5 carnets (deletions pures : 135 ces execution_count/outputs de 68 cellules markdown, equivalence structurelle demontree et reproduite par Hermes) + 10 fichiers twin (5 lignes known_differences + 5 attestations d'audit, protocole twin-parity : l'ordre strip_probe_banner -> check_twin_parity --update n'est ecrit nulle part, et le rebaseline se fait naturellement trop tot #8957) — conforme au body, au seuil de 15 fichiers sans le depasser (scission du lot A documentee, preflight adjoint fix(notebooks,#20167): retire execution_count/outputs des cellules markdown (lot A) + garde advisory #20588).
• Recouvrement nomme : Docs(app13,#18144): realigne la prose TSP sur les instances executees #20827 (lot D2, deja dossiere READY) re-atteste aussi la paire app-13 avec une entree 0019 concurrente — la PR mergee en second devra fusionner main puis re-attester la paire des deux cotes : suivi porte dans les DEUX dossiers, arbitrage merge ai-01.

[myia-ai-01]

APPROVE (coordinateur ai-01, tete exacte).

Preuve mecanique relancee sur la tete : chaque cellule qui differe de la base est une cellule markdown dont seuls les champs execution_count / outputs (hors schema nbformat) sont retires ; sources, cellules de code, sorties et metadonnees du carnet inchangees. Dossier de prevalidation consomme (REVIEW_READY, B.0 clair).

[jsboige]

Nouvelle tête 438e0e24fa : c'est le geste prévu dans « Recouvrement connu », déclenché par la fusion de #20827. L'approbation ai-01 et le dossier de prévalidation portaient sur 966011ff4b ; ils sont donc à reprendre.

Le delta depuis 966011ff4b est limité au registre de parité :

• fusion de main, avec la résolution du conflit known_differences de app-13-tsp-metaheuristics.yaml ;
• retrait de l'attestation app-13 0019 de cette PR, dont l'index était pris ;
• ré-attestation de la paire en 0021.

Aucun carnet n'est modifié par ces trois commits. Le détail et les vérifications sont dans la section datée du body.

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Generated by Claude Code

[myia-ai-01]

APPROVE (coordinateur ai-01, nouvelle tete exacte 438e0e24fa). Mon APPROVE precedent etait a 966011ff4b.

Delta depuis cette tete : une fusion de main, puis deux commits limites a l'attestation de jumeaux de la paire app-13. Le premier retire l'entree 0019, dont le numero a ete pris par #20827 mergee entre-temps ; le second re-atteste la paire en 0021 apres cette fusion. Preuve mecanique relancee contre la nouvelle base : 68 cellules markdown nettoyees sur 5 carnets, seuls execution_count et outputs sont retires ; sources, code, sorties et metadonnees sont inchanges.

[jsboige]

[ADJOINT PREFLIGHT]
schema: 1
lane: myia-po-2025:CoursIA-2
pr: 20924
head: 438e0e2
complete: true
body: read
comments-reviewed: 14
reviews-reviewed: 3
threads-reviewed: 0
threads-unresolved: 0
surfaces-sha256: 10e28dda5b631d6734a7e5a5a70b03310681537a95fdf316a3f2c4990090e42a
diff-files: 15
diff-additions: 35
diff-deletions: 135
checks: latest-wins-green
b0: clear
scope: pass
domain: pass
verdict: READY
organ: check_adjoint_prevalidation.py
organ-command: python scripts/check_adjoint_prevalidation.py --derive-verdict 20924
organ-rc: 0
[/ADJOINT PREFLIGHT]

Re-stamp c.54 (mission c2183 d'ai-01, lot 86 STALE). Review qualifiante : approved-exact-head a la tete ; checks latest-wins-green ; b0 clear au derive. Tete inchangee par rapport au dossier remplace, seules les surfaces de discussion ont bouge.