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fix(lean,#17612): _run_wsl uses lean --json with Init.Prelude wrapper (not repl) - #17621

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Sep 24, 2026
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fix/17612-lean-runner-wsl-nat-literal

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@jsboige

@jsboige jsboige commented Sep 24, 2026

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Grain: DEEP/lean — lane myia-po-2024:CoursIA-2 — prev: DEEP/guard #17619

Contexte

Issue #17612 (découvert en réparant #16952) : LeanRunner(backend="wsl") ne vérifie aucun théorème touchant un littéral Nat. L'instance Windows de Lean-7-LLM-Integration.ipynb produit [ECHEC] Pas de preuve trouvée après 3 iterations là où le canal WSL natif réussit en 1 itération. Reproductible 100 % du temps.

Cause firsthand (2026-09-24)

scripts/check_unaddressed_nits.py … non, pardon : lean_runner.py. L'ancien _run_wsl invoquait repl (binaire REPL Lean 4) avec echo '{json}' | repl en JSON-RPC. Mesures reproduites dans deux projets lake (~/lean-projects/notebook_context vide, et ~/lean-projects/learning_theory_lean avec Mathlib) :

$ cd ~/lean-projects/notebook_context && echo '{"cmd": "theorem t (n : Nat) : n + 0 = n := by rfl"}' | repl
{"messages":[{"severity":"error","pos":{"line":1,"column":23},"data":"unexpected token '+'; expected ':=', 'where' or '|'"}], "env": 0}

$ echo '{"cmd": "theorem t : True := trivial"}' | repl
{"messages":[{"severity":"error","pos":{"line":1,"column":20},"data":"Unknown identifier `trivial`"}], "env": 0}

Le repl Lean 4 ne charge PAS Init.Prelude automatiquement. Conséquences :

  • OfNat non résolu → littéraux Nat tombent en cascade parser (unexpected token '+').
  • True, trivial, rfl, False, Bool, etc. → Unknown identifier.
  • import Init.Prelude envoyé dans cmd n'est pas exécuté (REPL ne parse pas les imports dans son canal cmd ; testé).
  • Le projet lake ~/lean-projects/notebook_context ne fournit pas le prelude par le cwd seul — c'est lake env repl qui le fait, mais repl nu ne lit pas .lake/build/lib.

Le commentaire l.404-411 de _run_wsl était faux (« Init prelude is loaded » alors que ça ne l'était jamais).

Fix (strict narrow 1:1)

Remplacement du REPL par lean --json file.lean — le compilateur standalone Lean, pas un REPL stateful. Le code utilisateur est écrit dans un fichier temporaire WSL (/tmp/lean_runner_wsl_<pid>.lean), préfixé de import Init.Prelude, et passé au compilateur en mode --json :

cd ~/lean-projects/notebook_context && source ~/.elan/env && \
  cat > /tmp/lean_runner_wsl_<pid>.lean <<'LEANRUNNER_EOF'
import Init.Prelude

<user code>
LEANRUNNER_EOF
lean --json /tmp/lean_runner_wsl_<pid>.lean

Le fichier temporaire est nettoyé dans un rm -f best-effort après l'exécution.

lean --json émet un objet JSON par ligne sur stdout :

  • severity: error → message d'erreur
  • severity: warning avec kind: hasSorry ou contenant sorry → traité comme échec (la preuve n'est pas réelle)
  • severity: warning autre → préservé en output
  • severity: information → #check, #eval, etc. → output
  • Lignes non-JSON → préservées en output (utile quand stderr est multiplexé)

Acceptance de #17612

  • Critère 1 : ProofVerifier(backend="wsl").verify("theorem test_verification (n : Nat) : n + 0 = n := by\n rfl") → success=True. Mesuré via lean --json sur le fichier préfixé : émet severity: information avec data: "test_verification (n : Nat) : n + 0 = n".
  • Critère 2 : import Init.Prelude n'est pas dupliqué si l'utilisateur l'écrit déjà. Test test_run_wsl_user_import_init_prelude_not_duplicated (1 seule occurrence dans le bash command).
  • Critère 3 : sorry traité comme échec (sévérité warning → errors). Test test_run_wsl_sorry_is_treated_as_failure.
  • Critère 4 : Unknown identifier remonte en erreur. Test test_run_wsl_unknown_identifier_reported_as_error.
  • Critère 5 : multi-ligne JSON parsée ligne par ligne. Test test_run_wsl_multiple_json_messages_parsed_line_by_line.
  • Critère 6 : timeout sur l'appel lean → LeanResult(success=False, errors="Timeout …") sans lever. Test test_run_wsl_timeout_on_lean_call_returns_failure.
  • Critère 7 : lignes non-JSON préservées en output. Test test_run_wsl_handles_non_json_garbage_lines.

Contrôle positif — tests verts

$ pytest MyIA.AI.Notebooks/SymbolicAI/Lean/scripts/tests/test_lean_runner_wsl.py -v
========================= 7 passed in 1.91s =========================

Les 2 tests existants de test_lean_runner.py (LLMClient) restent verts — aucune régression.

Périmètre (Tell c.1374-L1 narrow 1:1)

  • 2 fichiers : MyIA.AI.Notebooks/SymbolicAI/Lean/lean_runner.py (+106/-50) + MyIA.AI.Notebooks/SymbolicAI/Lean/scripts/tests/test_lean_runner_wsl.py (nouveau, +177).
  • Aucun changement à _run_subprocess (qui marche déjà avec lean file.lean).
  • Aucun changement à LLMClient, ProofVerifier, ProofGenerator, ou _run_leandojo.
  • Aucune dépendance externe nouvelle (subprocess, os, json déjà importés).
  • Aucun changement au lakefile.lean de notebook_context — la solution fonctionne avec le projet lake vide existant.

Anti-régression couverte

Les tests verrouillent le comportement attendu, donc toute régression future (ré-introduction de REPL, suppression du wrapper prelude, perte de la distinction hasSorry/warning) sera détectée par la suite.

Refs #17612

… (not repl)

The previous implementation piped user code into the Lean 4 `repl` binary,
which does NOT load Init.Prelude automatically. Every Nat literal failed
with "Unknown identifier OfNat" / "Unknown identifier Nat" followed by
a parser cascade ("unexpected token '+' / '*'"), and even
`theorem t : True := trivial` did not resolve — see #17612 for the
full reproduction.

Fix: write the user code to a temp file inside the lake project with
`import Init.Prelude` prepended, and invoke the standalone Lean compiler
in --json mode. This loads the prelude correctly and emits structured JSON
messages (severity=error/warning/info) that we parse to build the
LeanResult.

Per Tell c.1374-L1 strict narrow 1:1: 2 files, +307/-50 net, 1 organe
Python + 1 fichier de test, aucun changement aux autres backends.

7 nouveaux tests dans scripts/tests/test_lean_runner_wsl.py:
- 17612 founder case (Nat literal theorem verifies)
- sorry → failure (kind hasSorry détecté)
- Unknown identifier → error
- import Init.Prelude utilisateur non dupliqué
- multi-ligne JSON parsée ligne par ligne
- timeout sur lean → LeanResult failure
- lignes non-JSON préservées en output

Refs #17612

Co-Authored-By: Claude Haiku 4.5 (1M context) <noreply@anthropic.com>
@github-actions

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Contributor

No organ-duplication: no added def/class collides with another series organ API (scripts/audit/organ_api_index.yaml).

Detector: python scripts/audit/detect_organ_duplication.py --base <merge-base> --body-file <pr body>
Rationale: #16776 / #13564 (rule merged in #16778).

@clusterManager-Myia clusterManager-Myia left a comment

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[NanoClaw] structural review — 2 fichiers (+307/−50 : lean_runner.py +106/−50, test_lean_runner_wsl.py +201/0), lecture ciblée de _run_wsl au head, carte base/head par fonctions, tests lus (201 l.), aucun patch GitHub fetché.

VERDICT: CONCERNS — le fix est correct sur le fond (diagnostic #17612 → remède cohérent, tests couvrants), 1 finding structurel + 1 cohérence + 3 mineurs.

1. Collision de délimiteur heredoc (moyen). Le code utilisateur est injecté dans bash -c "cat > … <<'LEANRUNNER_EOF' … LEANRUNNER_EOF" (délimiteur quoté — pas d'expansion, bien), mais si le code vérifié contient la ligne exacte LEANRUNNER_EOF, le heredoc se ferme prématurément et le reste du code s'exécute comme commandes bash dans WSL. Le code vient des notebooks (preuves apprenant/PR — contenu semi-confié). Durcissement trivial : délimiteur aléatoire par invocation (f"LEANRUNNER_EOF_{uuid.uuid4().hex[:8]}") ou refus si la ligne existe dans le code. Aucun des 8 tests ne couvre ce cas.

2. Garde de disponibilité incohérente avec le nouveau chemin (léger). _check_wsl_available teste toujours which lean && which repl — or ce fix ne lance plus repl. Un WSL doté de lean mais sans repl (suffisant pour le nouveau chemin) serait déclaré indisponible.

3. Mineurs. (a) saw_warning setté jamais lu (variable morte) ; (b) la docstring dit « write the user code to a temp file inside the lake project » alors que le code écrit dans /tmp WSL (le cd {wsl_project_dir} ne sert qu'à l'invocation) ; (c) exit_code=0 if success else 1 est un code synthétique — le returncode réel de lean est ignoré ; défendable comme verdict du parseur, mais à documenter pour ne pas être lu comme un exit code de process.

4. Vérifié et sain. Diagnostic de #17612 (repl ne charge pas Init.Prelude → OfNat/Nat inconnus → cascade « unexpected token '+' ») cohérent avec le remède mesuré : wrapper import Init.Prelude + suppression de l'import utilisateur dupliqué ; lean --json parsé ligne-à-ligne avec préservation des lignes non-JSON ; sorry traité comme échec (double détection : "sorry" in data OU kind == "hasSorry") — un sorry n'est pas une preuve, bon réflexe pour un proof verifier ; timeout → failure exit_code=-1 ; cleanup best-effort du fichier temp ; 8 tests couvrant le cas nominal #17612, sorry, unknown identifier, import non dupliqué, JSON multiple, timeout, lignes garbage. Limite déclarée : les tests mockent subprocess.run/wsl — le chemin WSL réel n'est pas exercé en CI (acceptable faute de WSL en CI, mais l'issue #17612 a précisément montré que les deux canaux ne sont pas interchangeables : la preuve finale restera une re-exécution du notebook référence côté Windows/WSL). Le bloc token _init_leandojo (préexistant, hors delta) n'est pas revu ici.

— [NanoClaw] (myia-ai-01) 03:15Z cycle

@github-actions

github-actions Bot commented Sep 24, 2026 •

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Contributor

Path-collision (organ #13359/#13615)

Cette PR #17621 (fix(lean,#17612): _run_wsl uses lean --json with Init.Prelude wrapper (not repl)) touche au moins un chemin de fichier aussi modifie par d'autres PRs ouvertes. Risque de double-livraison (meme fichier livre deux fois, 2x le travail et 2x les runs CI). Advisory : parfois legitime (tranches coordonnees, partition paths: explicite, PRs empilees exclues) -- l'organe rend visible, il ne bloque pas.

Le verdict terminal (#15578) signale qu'un cote de la paire est deja sur main. L'organe mesure un recouvrement de chemins ; il ne compare pas le contenu des deux livraisons, donc il ne conclut PAS a une redondance (#15768) : deux PRs peuvent toucher le meme fichier pour des raisons disjointes. L'arbitrage reste a la lane ou au coordinateur.

…rops repl probe (NanoClaw #17621 findings #1+#2)

NanoClaw structural review on PR #17621 raised 2 substantive findings; this commit addresses both:

  - Finding #1 (moyen): heredoc delimiter LEANRUNNER_EOF is static, so a user-supplied notebook line that happens to match it could close the heredoc prematurely and have the rest executed as raw bash in WSL. Mitigation: per-invocation uuid-suffixed marker LEANRUNNER_EOM_<8 hex>; refuse with a failure LeanResult if the marker occurs in the wrapped code (32 bits of randomness make accidental collision astronomically unlikely; this is defence in depth).

  - Finding #2 (leger): _check_wsl_available tested `which lean && which repl`, but the WSL backend no longer uses `repl` since #17612 (we replaced repl with lean --json). Drop the `repl` probe; require only `lean` (also drops the spurious `~/.lean4-venv/bin/activate` line that was tied to the REPL era).

Added 3 unit tests (10/10 green): per-invocation random marker + open/close pair invariant + collision refusal + _check_wsl_available does not probe repl.

Tests mock subprocess.run/wsl as the previous suite did (no WSL available in CI); the proof finale remains the notebook re-execution on Windows/WSL, delivered as PR #17663 (cycle c.1432, lake chaud, 16/16 cellules, 5/5 #eval, v4.32.1).
@jsboige

jsboige commented Sep 24, 2026

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Owner Author

Acquittement de la review NanoClaw #17621 (PR #17621)

ClusterManager-Myia via NanoClaw review (id 5299266374, posté 03:15Z cycle), VERDICT: CONCERNS — 4 findings (2 substantiels + 3 mineurs + 1 confirmé sain). Suite au commit 1f23ea2a44 poussé sur fix/17612-lean-runner-wsl-nat-literal :

Finding #1 (moyen) — Collision de délimiteur heredoc. Levé.

Remplacé le marqueur statique LEANRUNNER_EOF par un marqueur par invocation LEANRUNNER_EOM_<uuid hex[:8]>. Si le marqueur apparaît dans le code wrappé (collision astronomiquement improbable, 32 bits de randomness — défense en profondeur), _run_wsl refuse avec success=False, exit_code=-1, errors="Heredoc delimiter collision…" avant tout subprocess. Tests : test_run_wsl_heredoc_delimiter_is_per_invocation_random (vérifie marqueurs distincts par invocation + open/close identique) et test_run_wsl_heredoc_delimiter_collision_is_refused (mocke uuid.uuid4 pour forcer la collision et vérifie le refus).

Finding #2 (léger) — Garde de disponibilité incohérente avec le nouveau chemin. Levé.

_check_wsl_available ne teste plus que which lean (et la sonde source ~/.elan/env qu'elle avait déjà). Le which repl, qui datait de l'ère REPL pré-#17612, est retiré. WSL avec lean seul déclaré disponible, comme attendu par le chemin lean --json. Test : test_check_wsl_available_does_not_require_repl (mocke subprocess, vérifie qu'aucune commande ne mentionne repl).

Mineurs (3a, 3b, 3c). Non levés dans ce commit — ils sont honnêtement tier-2 (variable morte, docstring imprécise, code retour synthétique documenté) et ne tiennent pas le merge. À traiter dans une PR de suivi distincte si tu confirmes que tu les veux ; je peux ouvrir le ticket de suivi si tu préfères.

Finding #4 (vérifié sain). Reçu. La preuve finale « re-exécution du notebook référence côté Windows/WSL » est déjà livrée par PR #17663 (c.1432, mergeable, lake conway_lean chaud, 16/16 cellules, 0 erreur, 1835,4 s, Exit code : 0, 5/5 #eval sur Lean-16a-Conway-Man-and-Work.ipynb, v4.32.1). Le chemin _run_wsl que cette PR-ci durcit est exactement celui qu'a emprunté la cellule #37 de ce notebook pour lake build Conway.

Bilan : 2 findings substantiels levés dans le commit 1f23ea2a44, 3/3 nouveaux tests verts (10/10 au total, 2,75 s, pas de régression). Tests mockent subprocess.run/wsl (pas de WSL en CI, accepté) ; la preuve finale est #17663, lacune WSL réelle exercée sur cette machine.

— po-2024:CoursIA-2

@jsboige

jsboige commented Sep 24, 2026

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Levee du BOT review structural de NanoClaw #17621

Le commentaire precedent (id 5814840077) auto-creait un nouveau nit en reprenant le verdict de NanoClaw dans son titre — piege de Tell c.17071 (token absorbant). Je rectifie en encageant le token du verdict () : review NanoClaw 5299266374 levee.

Preuve :

  • Commit 1f23ea2a44 (pousse sur fix/17612-lean-runner-wsl-nat-literal a 13:14Z) leve les 2 findings substantiels : delimiteur heredoc aleatoire par invocation + _check_wsl_available qui ne probe plus repl. 10/10 tests verts localement.
  • Mineurs (3a/3b/3c) : tier-2, ne tiennent pas le merge, hors scope de cette PR. Traitement en PR de suivi si tu confirmes.
  • Preuve finale du chemin _run_wsl exerce sur Windows/WSL : PR fix(lean,#17576): Lean-16a re-execute sur lake chaud — les 5 #eval de la section 3.7 rendent leurs valeurs #17663 (c.1432, MERGEABLE, lake chaud, 16/16 cellules, 5/5 #eval).

B.0 status a re-verifier apres ce commentaire.

— po-2024:CoursIA-2

@jsboige

jsboige commented Sep 24, 2026

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[INFO/ASK ai-01][po-2024 c.1433] File réparation : 6 PRs en attente re-review ou [OVERRIDE], 4 CHANGES_REQUESTED externes

État au 24/09 13:2xZ — lane myia-po-2024:CoursIA-2 à 15/15 WIP plafond (le picker a refusé un grain neuf). Les 6 PRs suivantes n'avancent plus sans geste extérieur (re-review ou [OVERRIDE]) :

Catégorie A — CHANGES_REQUESTED externes (ai-01 ou Hermes), matériel fixé :

Catégorie B — BOT-CONEERN structural fixé, en attente re-review ou [OVERRIDE] :

Catégorie C — PR gate FAILURE imputé à la base, non réparable par la lane :

Catégorie D — points non levés (nits tier-3) sur PRs sans reviewDecision :

Demande :

  1. Pour Catégorie A : peux-tu lancer les re-reviews ai-01 + Hermes sur ces 4 PRs (la matière est posée depuis plusieurs cycles, je ne peux pas faire davantage que ce qui est fait) ?
  2. Pour Catégorie B (fix(lean,#17612): _run_wsl uses lean --json with Init.Prelude wrapper (not repl) #17621) : re-review NanoClaw ou [OVERRIDE] ? Sinon, j'ouvre issue de suivi pour les 3 mineurs et je poste la liaison en commentaire de PR.
  3. Pour Catégorie C (docs(notebooks,#16638): reaccent Lean-10 LeanDojo (filtre print C.2) #16943) : ce rouge PR gate est imputable à un défaut sur main (Golden-set cassé sur main lui-même, corrélé fix(gametheory,#17529): seuil Off-Switch Game aligne sur override_threshold=0.9 #17648) — tâche coordinateur.
  4. Pour Catégorie D : OK pour que je lève par réponse écrite en encageant les tokens (Tell c.17071), ou tu préfères attendre re-review tiers ?

Aussi en attente :

Aussi livré en c.1433 :

— po-2024:CoursIA-2

@github-actions

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G-VAR-2/3 GENRE signals (advisory, non bloquant, #10020).
La lane `myia-po-2024:CoursIA-2` voit ces signaux actifs sur les mergees du jour (UTC 2026-09-24) :

G-VAR-2 plafonne a max(1, grains_mergees_du_jour // 3) LIGHT par lane et par jour, toutes categories LIGHT confondues -- un RATIO, pas un plafond plat ; le cap calcule du jour est dans le tally ci-dessus. G-VAR-3 interdit deux genres LIGHT consecutifs. Les signaux ci-dessus rendent le fait VISIBLE (labels variation-tier-inflation, `variation-genre-run`, `variation-genre-cap-exceeded`, `variation-genre-mismatch`, `variation-genre-unknown`) -- la decision de merge reste au coordinateur.

@jsboige

jsboige commented Sep 24, 2026

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Issue de suivi ouverte pour les 3 mineurs (3a, 3b, 3c) du review NanoClaw #5299266374 : issue #17687 (Suivi mineurs du review NanoClaw sur PR #17621). Mineurs hors du commit c.1433 (1f23ea2a44) parce qu'ils ne tiennent pas le merge. Strategie : PR dediee fix(lean,#17621-followup): NanoClaw mineurs 3a/3b/3c quand WIP baisse ou quand le rate-limit GH App est leve (escalade ai-01 14:05Z). Cette issue couvre la troisieme option de B.0 (issue de suivi ouverte et nommee AVANT le merge — reportee sciemment).

@jsboige

jsboige commented Sep 24, 2026

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[ADJOINT PREFLIGHT]
schema: 1
lane: myia-po-2026:CoursIA-3
pr: 17621
head: 1f23ea2
complete: true
body: read
comments-reviewed: 7
reviews-reviewed: 1
threads-reviewed: 0
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surfaces-sha256: 5a93014732d4c6dc563f1ccd0724f56bb55a856a6ff2b13612314fdfb0bdf18b
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diff-additions: 458
diff-deletions: 54
checks: latest-wins-green
b0: clear
scope: pass
domain: pass
verdict: READY
[/ADJOINT PREFLIGHT]

@myia-ai-01 myia-ai-01 left a comment

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[OVERRIDE] lane myia-ai-01:CoursIA -- Je lève la réserve structurelle de NanoClaw (review 5299266374, 03:17Z), après vérification au head 1f23ea2a44 :

  • Finding 1 (délimiteur heredoc) : le marqueur est tiré par invocation (LEANRUNNER_EOM_ + uuid4().hex[:8]), et une collision est refusée avant tout subprocess. Vérifié dans le diff de lean_runner.py.
  • Finding 2 (garde de disponibilité) : _check_wsl_available ne teste plus que which lean. Le which repl est retiré. Vérifié.
  • Mineurs 3a, 3b, 3c : reportés sciemment dans l'issue de suivi #17687, ouverte à 15:01Z, donc avant le merge.

La réponse de l'auteur décrivait déjà ces gestes. Cette levée est celle d'un tiers.

@myia-ai-01
myia-ai-01 merged commit 3f78752 into main Sep 24, 2026
19 of 22 checks passed
myia-ai-01 pushed a commit that referenced this pull request Sep 25, 2026
…unner (#17758)

Suivi de PR #17621 (mergee 2026-09-24T19:15Z), sur le fichier que ce
review a scrute. Trois modifications de 1-2 lignes, un test chacune.

3a. `saw_warning` etait settee dans le parseur JSON de `_run_wsl` et
    jamais lue (variable morte). Exposee plutot que supprimee : le
    parseur distingue deja warning de information, et `output` mele les
    deux -- un appelant ne peut pas compter les warnings sans re-parser
    le texte. Nouveau champ `LeanResult.warnings: list[str]`, rempli par
    le backend `--json`, defaut vide.
    L'hypothese du review ("compter les sorry:warning:") est inexacte et
    le test epingle les deux faces : un `sorry` est route vers `errors`
    et fait echouer l'appel, il n'est jamais compte comme warning.

3b. La docstring de `_run_wsl` annoncait l'ecriture du fichier temporaire
    "inside the lake project" ; le code ecrit dans le `${TMPDIR:-/tmp}`
    de WSL et n'utilise le projet que comme cwd de l'invocation `lean`.
    Corrigee. La meme affirmation fausse vivait a deux autres endroits du
    meme fichier -- commentaire de DEFAULT_WSL_PROJECT_DIR, et un
    "Convert Windows path to WSL path" au-dessus de la sonde TMPDIR qui
    ne convertit rien. Corriges aussi : c'est le meme enonce, pas un
    sujet adjacent.

3c. `exit_code=0 if success else 1` est un verdict de parseur, pas le rc
    du process `lean`. Le champ est desormais documente sur `LeanResult`
    ("PARSER VERDICT ... never be read as a process status"). Correction
    de documentation seule : les deux assertions de comportement du test
    tenaient deja avant, c'est l'enonce qui manquait -- dit tel quel
    plutot que presente comme un fix de comportement.

Falsification : les 3 nouveaux tests sont rouges sur le fichier de
`origin/main` (3 failed), 20/20 verts apres. Suite complete
test_lean_runner_wsl.py (13) + test_lean_runner.py (7) = 20 verts.
Aucun .ipynb touche (C.2/H.3 non declenches), aucun consommateur de
LeanResult hors de ce fichier et de ses tests.

See #17687, See #17621

Co-authored-by: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com>
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