courses/learning-resources.qmd at main · WangLabCSU/courses · GitHub

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title: "学习资源"
subtitle: "R语言与生物信息学学习资料汇总"
description: "精选的R语言学习资源、生物信息学教程和相关工具"
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## 概述

本页面整理了R语言学习、生物信息学分析和数据科学相关的优质资源，帮助你在课程之外继续深入学习。

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## 📚 R语言基础与数据科学

### 中文资源

| 资源名称 | 链接 | 说明 |
|---------|------|------|
| R for Data Science (中文版) | [sunpast.github.io/r4ds](https://sunpast.github.io/r4ds/) | R数据科学经典教材的中文翻译版 |
| R for Data Science (WangLab版) | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/R_for_Data_Science) / [在线阅读](https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/) | 实验室维护的R4DS中文版 |
| 李东风R语言教程 | [math.pku.edu.cn](https://www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/docs/Rbook/html/_Rbook/index.html) | 北京大学李东风老师的R语言教程 |

### 推荐学习路径

1. **初学者**：从 [R for Data Science](https://sunpast.github.io/r4ds/) 开始，掌握 tidyverse 生态
2. **进阶者**：阅读实验室版本的 [R4DS扩展内容](https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/)
3. **实践者**：参考本课程的实验指导进行动手练习

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## 🧬 生物信息学资源

### 实验室课程与教程

| 资源名称 | 链接 | 说明 |
|---------|------|------|
| Curated-List | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/Curated-List) | 生物信息学资源精选列表 |
| Bioconductor RNAseq | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/bioc-rnaseq) | Bioconductor RNA-seq分析教程 |
| Workshop RNAseq | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/workshop-RNAseq) | RNA-seq分析工作坊 |
| Bioconductor Project | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/bioc-project) | Bioconductor项目模板 |
| RBiocBook | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/RBiocBook) | R与Bioconductor书籍 |
| BS831 | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/BS831) | 生物信息学算法课程 |
| LINCS Workshop 2020 | [GitHub](https://github.com/WangLabCSU/lincs-workshop-2020) | LINCS项目工作坊 |

### 特色资源

::: {.callout-tip}
## 推荐学习顺序

1. **R基础** → 本课程 + [R4DS](https://sunpast.github.io/r4ds/)
2. **Bioconductor入门** → [bioc-project](https://github.com/WangLabCSU/bioc-project)
3. **RNA-seq分析** → [bioc-rnaseq](https://github.com/WangLabCSU/bioc-rnaseq)
4. **综合应用** → [RBiocBook](https://github.com/WangLabCSU/RBiocBook)
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## 🎓 国际工作坊与课程

### RAUKR (RaukR)

瑞典生物信息学高级R编程课程：

| 年份 | 链接 | 说明 |
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| RAUKR 2024 | [GitHub](https://github.com/NBISweden/raukr-2024) | 2024年课程资料 |
| RAUKR 2025 | [GitHub](https://github.com/NBISweden/raukr-2025) | 2025年课程资料 |
| RAUKR 2026 | [GitHub](https://github.com/NBISweden/raukr-2026) | 2026年课程资料 |

### NBIS Workshops

瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS)提供的高质量工作坊：

| 工作坊 | 链接 | 内容 |
|--------|------|------|
| NGS Intro | [GitHub](https://github.com/NBISweden/workshop-ngsintro) | NGS数据分析入门 |
| RNA-seq | [GitHub](https://github.com/NBISweden/workshop-RNAseq) | RNA-seq数据分析 |
| scRNA-seq | [GitHub](https://github.com/NBISweden/workshop-scRNAseq) | 单细胞RNA-seq分析 |

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## 🔧 工具与平台

### 开发工具

- **RStudio**: [posit.co](https://posit.co/) - R语言最佳IDE
- **Quarto**: [quarto.org](https://quarto.org/) - 现代科学出版工具
- **GitHub**: [github.com](https://github.com) - 代码托管与协作

### Bioconductor

- **官网**: [bioconductor.org](https://bioconductor.org/)
- **学习资源**: [bioc-rnaseq](https://github.com/WangLabCSU/bioc-rnaseq)
- **包搜索**: 使用 `BiocManager::available()`

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## 🤝 社区与支持

- **GitHub Discussions**: 在资源仓库中提问
- **实验室主页**: [wanglabcsu.github.io](https://wanglabcsu.github.io/)
- **联系教师**: wangshx@csu.edu.cn

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::: {.text-center .mt-5}
**持续更新中...**
最后更新：2026年2月
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